生化研究所共有九层, 地下六层，地上三层。

研究所的特殊设计，足够前来工作的研究员在此处自给自足。干净的独立水源, 引用地下水进行发电，果蔬等日常需要的食物，在自然资源丰富的森林更是可以轻易培养与获取。